| dc.description.abstract | Los factores sigma primarios son proteínas esenciales para la supervivencia bacteriana porque transcriben la mayoría de genes relacionados con el mantenimiento celular (housekeeping). RpoD, el factor sigma primario de Escherichia coli (γ-proteobacteria) reconoce un promotor consenso cuya secuencia es altamente similar a los consensos reportados en algunas especies de α-proteobacterias. A pesar de esta similitud, RpoD es incapaz de transcribir usando promotores pertenecientes a esta segunda clase taxonómica. Por su parte, SigA (48% de identidad, 98% de cobertura vs RpoD), el factor sigma primario de Rhizobium etli (α-proteobacteria), es competente para transcribir utilizando la mayoría de promotores RpoD-dependientes probados hasta el momento. Hemos nombrado a este fenómeno laxitud transcripcional. Durante esta investigación se demostró que SigA complementa parcialmente el fenotipo termosensible del alelo RpoD285 perteneciente a la cepa UQ285 de E. coli. Asimismo, se identificó a la región σ4 de SigA como la responsable de esta habilidad de complementación. Dieciséis de 74 residuos (21.6%) dentro de las regiones σ4 son variables entre RpoD y SigA. Mutaciones en estas posiciones mejoran significativamente la capacidad de SigA para complementar el fenotipo de E. coli UQ285. Seis de los residuos mencionados forman parte del motivo hélice-vuelta-hélice (HTH) que interactúa con el promotor. El resto de residuos variables se localizan en posiciones inexploradas previamente, específicamente dentro de las primeras dos α-hélices de la region σ4. Ninguno de estos diez residuos parece interactuar directamente con el promotor, en lugar de eso, se propone que contribuyen de forma alostérica al correcto posicionamiento y/o plegamiento del motivo HTH. Posiblemente la laxitud transcripcional sea un mecanismo que asegura la transcripción a pesar del potencial efecto negativo de las mutaciones ocurridas naturalmente en los promotores endógenos y/o a partir de secuencias de DNA transferidas horizontalmente; dicha estrategia pudo ayudar a la supervivencia y adaptación de las α-proteobacterias. | en_US |
